近世に入り徳川家康が江戸幕府を開き、横浜北部の村々は江戸が近いため、当初は幕府の直轄地が多くありました。その後天領、旗本領の入り交じった支配となります。
石川村は芝の増上寺領であり、徳川秀忠夫人、崇源院（お江）の化粧料地となりました。この化粧料地は、その後御霊屋（みたまや）料地となります。
石川村は武蔵国都筑郡の北に位置し、東は橘樹郡の有馬村・土橋村、西は王禅寺村、南は荏田村・大場村・黒須田村・鉄村、北は橘樹郡下菅生村に接していました。 石川村の一番上の保木からは早渕川が発し、南東に向けて流れ、1里（4キロ）程で荏田村に入っていきます。石川村全体が一つの大きな谷戸であり標高は20〜95メートルと大変起伏の富んだ地形でした。
石川村の石高（村の米穀などの生産量）は500石（1644〜1648年）で、その後921石（1848〜1854年）に倍増しています。石川村の家数は風土記稿*などによると267戸（1818〜1830年）、270戸（1848〜1854年）とあります。
近世の石川はいくつかの小名（こな）と呼ばれる小集落によって構成されていました。保木、荏子田、平川、船頭、稗田原、牛込、下谷、中村。その中で一番上の集落の「保木」と一番下の集落の「下谷」に、保木村・下石川村の標記のある石造物が存在している。 このように小名を村名のように記されているのを「緑区史」では「村の中のムラ」と称しています。保木や下石川は石川の地域の中で、独立性が強かったのではないだろうかと考えられています。
1734年、増上寺輪番役人が寺社奉行へ提出した鉄砲書上帳から、近世の石川村を知る手がかりがあります。これによると春に石川村、王禅寺村、川和村、荏田村へ16挺の鉄砲を貸し出し冬に返却させたというものである。この年石川では猪3頭、鹿4頭を仕留めたそうで、山や畑が多かった石川では、猪や鹿が多く生息し田畑を荒らしたものと考えられますが、現在の風景からは想像がつきません。
| 1600年 | 関ヶ原の戦い |
| 1603年 | 江戸幕府が成立 |
| 1615年 | 大坂夏の陣で豊臣氏滅亡 |
| 1637年 | 島原の乱 |
| 1702年 | 赤穂浪士浅野の仇討 |
| 1707年 | 富士山が噴火 |
| 1782年 | 天明の大飢饉 |
| 1821年 | 伊能忠敬日本地図完成 |
| 1853年 | ペリー来航 |
| 1863年 | 薩英戦争 |
| 1867年 | 大政奉還 |
| 1602年 | オランダが東インド会社を設立 |
| 1618年 | ドイツ三十年戦争 |
| 1636年 | 清を建国 |
| 1687年 | ニュートンが万有引力の法則を発見 |
| 1707年 | 大ブリテン王国が成立 |
| 1776年 | アメリカ、独立宣言 |
| 1789年 | フランス革命 |
| 1804年 | フランス、ナポレオン皇帝即位 |
| 1840年 | イギリスと清の間でアヘン戦争 |
| 1853年 | ロシア、クリミア戦争 |
| 1861年 | アメリカ、南北戦争 |
*風土記稿とは江戸時代後期を中心に郡村概況を記した地誌である。
村単位で、地形、戸数、人物、自然、神社、寺院、名所、伝説など多岐に渡って記述されている。
